1.10 所有的病毒和细菌感染都对人有害吗？

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这取决于所感染的类型，并不是所有存活在我们体内或体表的微生物都是潜在的病原体。有些在我们呼吸道和胃肠道的黏膜上皮细胞表面生存的微生物，被称为“共生微生物”。例如一些居住在人类肠道的细菌，它们能够产生帮助分解各种食物的酶，还有一些基本营养素，如维生素B7（生物素）、维生素B12和烟酸等。正常肠道菌群约占人体粪便干重的50%，除了对饮食的贡献外，还大大挤占了其他的、致病性更强的微生物的空间。近年来，“益生菌”如何界定的问题，引起了科学家的强烈兴趣，特别是抗生素的过度使用，可能会影响这些肠道细菌的种类分布，以致被那些“坏的微生物”侵占，例如这些“坏的微生物”可能产生毒素并穿透胃肠道壁而被吸收到血液中。

然而，共生微生物并不都是有益的。特别是当我们的免疫系统由于某些原因失效时，通常存活在消化道和呼吸道的良性“居民”可能会被隐孢子虫（某种共生寄生虫）或肺孢子菌（某种真菌）侵入组织，可能分别导致致命的腹泻或呼吸问题。又如，由治疗癌症导致的大规模免疫抑制，或在那些感染了HIV/AIDS而未经治疗(药物)的患者体内出现几乎不可避免的免疫系统崩溃。生长在我们的皮肤上的金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)偶尔会引起疖子、粉刺，也可能成为手术后感染的一个主要原因。对于免疫缺陷个体来说，共生微生物可能会成为病原体，有时还会成为导致医院感染暴发的危险因素（如金黄色葡萄球菌）。即便如此，它们也不会引起流行，更不会引起大流行。